Programa implementado desde 1986 en el ámbito de la Microcuenca de Huarmiragra (distrito de Tomayquichua) y Pichgacocha (Distrito de Conchamarca), desde finales de 1994 en la Microcuenca de Mancapozo (Distrito de Amarillis) y a partir de 1996 en la Cuenca del río Higueras (distrito de Kichki) y, a partir del 2000, la Cuenca de Churubamba (distrito de Churubamba), con una superficie que alcanza los 870 km2, comprendiendo ecosistemas que varían entre los 1800 a 4500 m.s.n.m. y asienta a una población que supera los 20,000 habitantes y que viven en condiciones de pobreza y extrema pobreza.

Desde 1,989 se estructura como Programa de Desarrollo Rural Sostenible a fin de tener una visión integral del proceso de desarrollo de los actores de cuenca. Se priorizó el trabajo en la parte alta y el valle. Entre las principales líneas de acción que viene desarrollando el programa tenemos: la Producción Agroecológica, Educación Ecológica y Ambiental, Organización y Planificación Rural, Conservación de recursos Naturales, Rescate Cultural y tecnologías Andinas y Seguridad Alimentaria.

El Programa tiene como ámbito de trabajo la microcuenca del río Mariño que abarca los distritos de Abancay y Tamburco; la microcuenca del río Acco en el distrito de Chacoche y la microcuenca de Pichirhua en el distrito de Pichirhua que son afluentes del río Pachachaca (microcuenca y comunidad a la vez), ubicadas sobre su margen derecha e izquierda respectivamente. Microcuencas ubicadas en la cadena sur-oriental de los Andes peruanos las cuales representan 1,450 km2 con altitudes que van desde los 1,900 msnm hasta los 5,300 msnm. Inicia sus actividades estructurada como Programa a mediados de 1987, siendo inicialmente su eje articulador la conservación del Santuario Nacional de Ampay y el desarrollo de las comunidades campesinas circundantes al Santuario. Actualmente, su visión estratégica involucra la gestión integral de cuencas, el manejo sostenible de los recursos renovables y la agricultura sostenible.

En mérito al concurso selectivo Nº 001-2004-AA, convocado por la Asociación Ancash (AA), el IDMA ejecuta desde setiembre del 2004 el proyecto: "Centro Piloto de Agricultura Ecológica Andina - Cochao", con el objetivo de contribuir al desarrollo rural de la zona, sobre la base de una gestión productiva, social, económica y ambientalmente sostenible.