La alta humedad del medio ambiente le permite al bosque alojar gran cantidad de plantas
, especialmente
y orquídeas de distintos colores y formas delicadas y caprichosas, que son la riqueza floral del Santuario. También se encuentran helechos musgos, hongos, etc.
El verde intenso de la floresta es salpicado por el variado colorido de las flores, entre las que se destacan diferentes especies de fuchsias, bomareas, begonias, etc., algunas de ellas son endémicas del Ampay .